背景技術：

1、反義寡核苷酸是可用于抑制與疾病相關的某些基因的表達的基于核酸的化合物。雖然反義寡核苷酸通常可以被設計成與靶基因雜交，但常規的反義寡核苷酸通常表現出較差的功效。為了開發表現出提高的性能和功效的經修飾的反義寡核苷酸，以用于預防、改善和治療疾病，需要開發可用于合成剪接轉換寡核苷酸(例如，包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸)的化合物(即結構單元(building?block))以及制備此類化合物的方式。

技術實現思路

1、本文公開了一種用于制備式(a)的化合物的方法：

2、(a)

3、所述方法包括：

4、保護式(i)的化合物：

5、(i)，

6、從而產生式(ii)的化合物：

7、(ii)，

8、其中

9、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

10、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

11、本文另外公開了一種用于制備式(a)的化合物的方法：

12、(a)

13、所述方法包括：

14、還原裂解式(ii)的化合物：

15、(ii)，

16、從而產生式(iii)的化合物：

17、(iii)。

18、本文另外公開了一種用于制備式(a)的化合物的方法：

19、(a)

20、所述方法包括：

21、使式(iii)的化合物烷基化：

22、(iii)，

23、從而產生式(iv)的化合物：

24、(iv)，

25、其中

26、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

27、本文另外公開了一種用于制備式(a)的化合物的方法：

28、(a)

29、所述方法包括：

30、使式(iv)的化合物脫保護：

31、(iv)，

32、從而產生式(v)的化合物：

33、(v)，

34、其中

35、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

36、本文另外公開了一種用于制備式(a)的化合物的方法：

37、(a)

38、所述方法包括：

39、保護式(v)的化合物：

40、(v)，

41、從而產生式(vi)的化合物：

42、(vi)，

43、其中

44、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3

45、本文另外公開了一種用于制備式(a)的化合物的方法：

46、(a)

47、所述方法包括：

48、在式(vi)的化合物上安裝(install)亞磷酰胺基團：

49、(vi)，

50、從而產生式(a)的化合物：

51、(a)。

52、本文另外公開了一種用于制備式(a)的化合物的方法：

53、(a)

54、所述方法包括：

55、保護式(i)的化合物：

56、(i)，

57、從而產生式(ii)的化合物：

58、(ii)，

59、還原裂解式(ii)的化合物，從而產生式(iii)的化合物：

60、(iii)，

61、使式(iii)的化合物烷基化，從而產生式(iv)的化合物：

62、(iv)，

63、使式(iv)的化合物脫保護，從而產生式(v)的化合物：

64、(v)，

65、保護式(v)的化合物，從而產生式(vi)的化合物：

66、(vi)，

67、在式(vi)的化合物上安裝亞磷酰胺基團，從而產生式(a)的化合物，

68、其中

69、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

70、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

71、本文公開了一種用于制備式(vi)的化合物的方法：

72、(vi)，

73、所述方法包括：

74、保護式(i)的化合物：

75、(i)，

76、從而產生式(ii)的化合物：

77、(ii)，

78、其中

79、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

80、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

81、本文另外公開了一種用于制備式(vi)的化合物的方法：

82、(vi)

83、所述方法包括：

84、還原裂解式(ii)的化合物：

85、(ii)，

86、從而產生式(iii)的化合物：

87、(iii)。

88、本文另外公開了一種用于制備式(vi)的化合物的方法：

89、(vi)

90、所述方法包括：

91、使式(iii)的化合物烷基化：

92、(iii)，

93、從而產生式(iv)的化合物：

94、(iv)，

95、其中

96、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

97、本文另外公開了一種用于制備式(vi)的化合物的方法：

98、(vi)，

99、所述方法包括：

100、使式(iv)的化合物脫保護：

101、(iv)，

102、從而產生式(v)的化合物：

103、(v)，

104、其中

105、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

106、本文另外公開了一種用于制備式(vi)的化合物的方法：

107、(vi)，

108、所述方法包括：

109、保護式(v)的化合物：

110、(v)，

111、從而產生式(vi)的化合物，

112、其中

113、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

114、本文另外公開了一種用于制備式(vi)的化合物的方法：

115、(vi)，

116、所述方法包括：

117、保護式(i)的化合物：

118、(i)，

119、從而產生式(ii)的化合物：

120、(ii)，

121、還原裂解式(ii)的化合物，從而產生式(iii)的化合物：

122、(iii)，

123、使式(iii)的化合物烷基化，從而產生式(iv)的化合物：

124、(iv)，

125、使式(iv)的化合物脫保護，從而產生式(v)的化合物：

126、(v)，

127、保護式(v)的化合物，從而產生式(vi)的化合物，

128、其中

129、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

130、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

131、本文公開了一種用于制備式(v)的化合物的方法：

132、(v)，

133、所述方法包括：

134、保護式(i)的化合物：

135、(i)，

136、從而產生式(ii)的化合物：

137、(ii)，

138、其中

139、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

140、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

141、本文另外公開了一種用于制備式(v)的化合物的方法：

142、(v)，

143、所述方法包括：

144、還原裂解式(ii)的化合物：

145、(ii)，

146、從而產生式(iii)的化合物：

147、(iii)。

148、本文另外公開了一種用于制備式(v)的化合物的方法：

149、(v)，

150、所述方法包括：

151、使式(iii)的化合物烷基化：

152、(iii)，

153、從而產生式(iv)的化合物：

154、(iv)，

155、其中

156、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

157、本文另外公開了一種用于制備式(v)的化合物的方法：

158、(v)，

159、所述方法包括：

160、使式(iv)的化合物脫保護：

161、(iv)，

162、從而產生式(v)的化合物，

163、其中

164、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

165、本文另外公開了一種用于制備式(v)的化合物的方法：

166、(v)，

167、所述方法包括：

168、保護式(i)的化合物：

169、(i)，

170、從而產生式(ii)的化合物：

171、(ii)，

172、還原裂解式(ii)的化合物，從而產生式(iii)的化合物：

173、(iii)，

174、使式(iii)的化合物烷基化，從而產生式(iv)的化合物：

175、(iv)，

176、使式(iv)的化合物脫保護，從而產生式(v)的化合物，

177、其中

178、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

179、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

180、本文公開了一種用于制備式(iv)的化合物的方法：

181、(iv)，

182、所述方法包括：

183、保護式(i)的化合物：

184、(i)，

185、從而產生式(ii)的化合物：

186、(ii)，

187、其中

188、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

189、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

190、本文另外公開了一種用于制備式(iv)的化合物的方法：

191、(iv)，

192、所述方法包括：

193、還原裂解式(ii)的化合物：

194、(ii)，

195、從而產生式(iii)的化合物：

196、(iii)。

197、本文另外公開了一種用于制備式(iv)的化合物的方法：

198、(iv)，

199、所述方法包括：

200、使式(iii)的化合物烷基化：

201、(iii)，

202、從而產生式(iv)的化合物，

203、其中

204、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

205、本文另外公開了一種用于制備式(iv)的化合物的方法：

206、(iv)，

207、所述方法包括：

208、保護式(i)的化合物：

209、(i)，

210、從而產生式(ii)的化合物：

211、(ii)，

212、還原裂解式(ii)的化合物，從而產生式(iii)的化合物：

213、(iii)，

214、使式(iii)的化合物烷基化，從而產生式(iv)的化合物，

215、其中

216、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

217、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

218、本文公開了一種用于制備式(iii)的化合物的方法：

219、(iii)，

220、所述方法包括：

221、保護式(i)的化合物：

222、(i)，

223、從而產生式(ii)的化合物：

224、(ii)，

225、其中

226、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

227、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

228、本文另外公開了一種用于制備式(iii)的化合物的方法：

229、(iii)，

230、所述方法包括：

231、還原裂解式(ii)的化合物：

232、(ii)，

233、從而產生式(iii)的化合物，

234、其中

235、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

236、本文另外公開了一種用于制備式(iii)的化合物的方法：

237、(iii)，

238、所述方法包括：

239、保護式(i)的化合物：

240、(i)，

241、從而產生式(ii)的化合物：

242、(ii)，

243、還原裂解式(ii)的化合物，從而產生式(iii)的化合物，

244、其中

245、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

246、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

247、本文公開了一種用于制備式(ii)的化合物的方法：

248、(ii)，

249、所述方法包括：

250、保護式(i)的化合物：

251、(i)，

252、從而產生式(ii)的化合物，

253、其中

254、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

255、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

256、本文公開了一種用于制備包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸(splice-switching?oligonucleotide)的方法，所述方法包括：

257、保護式(i)的化合物：

258、(i)，

259、從而產生式(ii)的化合物：

260、(ii)，

261、其中

262、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

263、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

264、本文另外公開了一種用于制備包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法，所述方法包括：

265、還原裂解式(ii)的化合物：

266、(ii)，

267、從而產生式(iii)的化合物：

268、(iii)。

269、本文另外公開了一種用于制備包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法，所述方法包括：

270、使式(iii)的化合物烷基化：

271、(iii)，

272、從而產生式(iv)的化合物：

273、(iv)，

274、其中

275、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

276、本文另外公開了一種用于制備包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法，所述方法包括：

277、使式(iv)的化合物脫保護：

278、(iv)，

279、從而產生式(v)的化合物：

280、(v)，

281、其中

282、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

283、本文另外公開了一種用于制備包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法，所述方法包括：

284、保護式(v)的化合物：

285、(v)，

286、從而產生式(vi)的化合物：

287、(vi)，

288、其中

289、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

290、本文另外公開了一種用于制備包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法，所述方法包括：

291、在式(vi)的化合物上安裝亞磷酰胺基團：

292、(vi)，

293、從而產生式(a)的化合物：

294、(a)，

295、其中

296、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

297、本文另外公開了一種用于制備包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法，所述方法包括：

298、保護式(i)的化合物：

299、(i)，

300、從而產生式(ii)的化合物：

301、(ii)，

302、還原裂解式(ii)的化合物，從而產生式(iii)的化合物：

303、(iii)，

304、使式(iii)的化合物烷基化，從而產生式(iv)的化合物：

305、(iv)，

306、使式(iv)的化合物脫保護，從而產生式(v)的化合物：

307、(v)，

308、保護式(v)的化合物，從而產生式(vi)的化合物：

309、(vi)，

310、在式(vi)的化合物上安裝亞磷酰胺基團，從而產生式(a)的化合物：

311、(a)，

312、其中

313、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

314、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

315、本文公開了一種用于制備包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法，所述方法包括本文所述方法中的任何一種，或其組合。

316、本文公開了一種用于使用式(a)的化合物制備包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法。本文另外公開了一種用于使用式(i)的化合物制備包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法。本文另外公開了一種用于使用式(ii)的化合物制備包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法。本文另外公開了一種用于使用式(iii)的化合物制備包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法。本文另外公開了一種用于使用式(iv)的化合物制備包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法。本文另外公開了一種用于使用式(v)的化合物制備包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法。本文另外公開了一種用于使用式(vi)的化合物制備包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法。

317、在一些實施方案中，包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸是pct公布號wo2021/247800中描述的任何包含一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸，所述公布在此通過引用整體并入。

318、本文公開了一種用于制備包含式(b)的一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法：

319、(b)，

320、所述方法包括：

321、保護式(i)的化合物：

322、(i)，

323、從而產生式(ii)的化合物：

324、(ii)，

325、其中

326、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；

327、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基；并且

328、每個符號代表與核苷間鍵的連接點。

329、本文另外公開了一種用于制備包含式(b)的一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法：

330、(b)，

331、所述方法包括：

332、還原裂解式(ii)的化合物：

333、(ii)，

334、從而產生式(iii)的化合物：

335、(iii)，

336、其中

337、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；

338、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基；并且

339、每個符號代表與核苷間鍵的連接點。

340、本文另外公開了一種用于制備包含式(b)的一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法：

341、(b)，

342、所述方法包括：

343、使式(iii)的化合物烷基化：

344、(iii)，

345、從而產生式(iv)的化合物：

346、(iv)，

347、其中

348、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

349、每個符號代表與核苷間鍵的連接點。

350、本文另外公開了一種用于制備包含式(b)的一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法：

351、(b)，

352、所述方法包括：

353、使式(iv)的化合物脫保護：

354、(iv)，

355、從而產生式(v)的化合物：

356、(v)，

357、其中

358、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

359、每個符號代表與核苷間鍵的連接點。

360、本文另外公開了一種用于制備包含式(b)的一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法：

361、(b)，

362、所述方法包括：

363、保護式(v)的化合物：

364、(v)，

365、從而產生式(vi)的化合物：

366、(vi)，

367、其中

368、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

369、每個符號代表與核苷間鍵的連接點。

370、本文另外公開了一種用于制備包含式(b)的一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法：

371、(b)，

372、所述方法包括：

373、在式(vi)的化合物上安裝亞磷酰胺基團：

374、(vi)，

375、從而產生式(a)的化合物：

376、(a)，

377、其中

378、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

379、每個符號代表與核苷間鍵的連接點。

380、本文另外公開了一種用于制備包含式(b)的一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法：

381、(b)，

382、所述方法包括：

383、保護式(i)的化合物：

384、(i)，

385、從而產生式(ii)的化合物：

386、(ii)，

387、還原裂解式(ii)的化合物，從而產生式(iii)的化合物：

388、(iii)，

389、使式(iii)的化合物烷基化，從而產生式(iv)的化合物：

390、(iv)，

391、使式(iv)的化合物脫保護，從而產生式(v)的化合物：

392、(v)，

393、保護式(v)的化合物，從而產生式(vi)的化合物：

394、(vi)，

395、在式(vi)的化合物上安裝亞磷酰胺基團，從而產生式(a)的化合物：

396、(a)，

397、其中

398、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；

399、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基；并且

400、每個符號代表與核苷間鍵的連接點。

401、本文公開了一種用于制備包含式(b)的一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法：

402、(b)，

403、所述方法包括本文所述方法中的任何一種，或其組合，其中每個符號代表與核苷間鍵的連接點。

404、在一些實施方案中，所述方法進一步包括：

405、還原裂解式(ii)的化合物：

406、(ii)，

407、從而產生式(iii)的化合物：

408、(iii)。

409、在一些實施方案中，所述方法進一步包括：

410、使式(iii)的化合物烷基化：

411、(iii)，

412、從而產生式(iv)的化合物：

413、(iv)，

414、其中

415、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

416、在一些實施方案中，所述方法進一步包括：

417、使式(iv)的化合物脫保護：

418、(iv)，

419、從而產生式(v)的化合物：

420、(v)，

421、其中

422、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

423、在一些實施方案中，所述方法進一步包括：

424、保護式(v)的化合物：

425、(v)，

426、從而產生式(vi)的化合物：

427、(vi)，

428、其中

429、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

430、在一些實施方案中，所述方法進一步包括：

431、在式(vi)的化合物上安裝亞磷酰胺基團：

432、(vi)，

433、從而產生式(a)的化合物：

434、(a)。

435、在一些實施方案中，保護式(i)的化合物包括使式(i)的化合物與第一堿接觸。在一些實施方案中，第一堿是無機堿。在一些實施方案中，第一堿是氫化物堿。在一些實施方案中，第一堿是nah。在一些實施方案中，保護式(i)的化合物包括使式(i)的化合物與bn-x1接觸，其中x1是離去基團。在一些實施方案中，x1是鹵代基。在一些實施方案中，x1是–cl、–br或–i。在一些實施方案中，x1是–br。在一些實施方案中，保護式(i)的化合物包括使式(i)的化合物與第一溶劑接觸。在一些實施方案中，第一溶劑是極性溶劑。在一些實施方案中，第一溶劑是四氫呋喃(thf)。在一些實施方案中，保護式(i)的化合物包括將反應溫度升高至回流。在一些實施方案中，保護式(i)的化合物包括將反應溫度升高至約65℃。

436、在一些實施方案中，還原裂解式(ii)的化合物包括使式(ii)的化合物與活化劑接觸。在一些實施方案中，活化劑包含三烷基甲硅烷基陽離子。在一些實施方案中，活化劑包含三甲基甲硅烷基陽離子。在一些實施方案中，活化劑是三氟甲磺酸三甲基甲硅烷基酯(trimethylsilyl?trifluoromethanesulfonate,?tmsotf)。在一些實施方案中，還原裂解式(ii)的化合物包括使式(ii)的化合物與還原劑接觸。在一些實施方案中，還原劑是有機甲硅烷基還原劑。在一些實施方案中，還原劑是三烷基硅烷。在一些實施方案中，還原劑是三乙基硅烷。在一些實施方案中，還原裂解式(ii)的化合物包括使式(ii)的化合物與第二溶劑接觸。在一些實施方案中，第二溶劑是鹵化溶劑。在一些實施方案中，第二溶劑是二氯甲烷(dcm)或二氯乙烷(dce)。在一些實施方案中，第二溶劑是二氯甲烷(dcm)。在一些實施方案中，還原裂解式(ii)的化合物包括將反應溫度降低至約0℃以下。在一些實施方案中，還原裂解式(ii)的化合物包括將反應溫度降低至約-18℃。在一些實施方案中，使式(iii)的化合物烷基化包括使式(iii)的化合物與第二堿接觸。

437、在一些實施方案中，第二堿是無機堿。在一些實施方案中，第二堿是氫化物堿。在一些實施方案中，第二堿是nah。在一些實施方案中，使式(iii)的化合物烷基化包括使式(iii)的化合物與烷基化劑接觸。在一些實施方案中，烷基化劑是r1–x2，其中x2是離去基團。在一些實施方案中，x2是鹵代基。在一些實施方案中，x2是–cl、–br或–i。在一些實施方案中，x2是–br。在一些實施方案中，x2是–i。在一些實施方案中，使式(iii)的化合物烷基化包括使式(iii)的化合物與第三溶劑接觸。在一些實施方案中，第三溶劑是極性溶劑。在一些實施方案中，第三溶劑是四氫呋喃(thf)。在一些實施方案中，使式(iii)的化合物烷基化包括將反應溫度降低至約10℃以下。在一些實施方案中，使式(iii)的化合物烷基化包括將反應溫度降低至約-10℃至約10℃。在一些實施方案中，使式(iii)的化合物烷基化包括將反應溫度降低至約0℃。

438、在一些實施方案中，使式(iv)的化合物脫保護包括使式(iv)的化合物與第一催化劑接觸。在一些實施方案中，第一催化劑是鈀催化劑。在一些實施方案中，第一催化劑是鈀(0)催化劑。在一些實施方案中，第一催化劑是鈀碳。在一些實施方案中，第一催化劑是約5重量%的鈀碳。在一些實施方案中，第一催化劑是約10重量%的鈀碳。在一些實施方案中，使式(iv)的化合物脫保護包括使式(iv)的化合物與約30?mol%的第一催化劑接觸。在一些實施方案中，使式(iv)的化合物脫保護包括使式(iv)的化合物與氫氣接觸。在一些實施方案中，使式(iv)的化合物脫保護包括使式(iv)的化合物與氫氣在大氣壓下接觸。在一些實施方案中，使式(iv)的化合物脫保護包括使式(iv)的化合物與第四溶劑接觸。在一些實施方案中，第四溶劑是質子溶劑。在一些實施方案中，第四溶劑是甲醇或乙醇。在一些實施方案中，第四溶劑是甲醇。在一些實施方案中，使式(iv)的化合物脫保護包括約23℃的反應溫度。

439、在一些實施方案中，保護式(v)的化合物包括使式(v)的化合物與第三堿接觸。在一些實施方案中，第三堿是有機堿。在一些實施方案中，第三堿是胺堿。在一些實施方案中，第三堿是三乙胺(tea)、n,n-二異丙基乙胺(dipea)、吡啶、二烷基吡啶或三烷基吡啶。在一些實施方案中，第三堿是吡啶、二烷基吡啶或三烷基吡啶。在一些實施方案中，第三堿是吡啶、2,6-二甲基吡啶(2,6-dimethylpyridine)(二甲基吡啶(lutidine))、2,4,6-三甲基吡啶、2,6-二異丙基吡啶或2,6-二叔丁基吡啶。在一些實施方案中，第三堿是2,6-二甲基吡啶(二甲基吡啶)。

440、在一些實施方案中，保護式(v)的化合物包括使式(v)的化合物與第二催化劑接觸。在一些實施方案中，第二催化劑是有機催化劑。在一些實施方案中，第二催化劑是胺催化劑。在一些實施方案中，第二催化劑是4-二甲基氨基吡啶(dmap)。在一些實施方案中，使式(v)的化合物脫保護包括使式(v)的化合物與約50?mol%的第二催化劑接觸。在一些實施方案中，保護式(v)的化合物包括使式(v)的化合物與dmt-x3接觸，其中x3是離去基團。在一些實施方案中，x3是鹵代基。在一些實施方案中，x3是–cl、–br或–i。在一些實施方案中，x3是–cl。在一些實施方案中，保護式(v)的化合物包括將反應溫度降低至約10℃以下。在一些實施方案中，保護式(v)的化合物包括將反應溫度降低至約-10℃至約10℃。在一些實施方案中，保護式(v)的化合物包括將反應溫度降低至約0℃。在一些實施方案中，保護式(v)的化合物包括使式(v)的化合物與第三堿接觸。在一些實施方案中，第三堿是有機堿。在一些實施方案中，第三堿是胺堿。在一些實施方案中，第三堿是三乙胺(tea)、n,n-二異丙基乙胺(dipea)、吡啶、二烷基吡啶或三烷基吡啶。在一些實施方案中，第三堿是吡啶、二烷基吡啶或三烷基吡啶。在一些實施方案中，第三堿是吡啶、2,6-二甲基吡啶(二甲基吡啶)、2,4,6-三甲基吡啶、2,6-二異丙基吡啶或2,6-二叔丁基吡啶。在一些實施方案中，第三堿是2,6-二甲基吡啶(二甲基吡啶)。在一些實施方案中，保護式(v)的化合物包括使式(v)的化合物與第二催化劑接觸。在一些實施方案中，第二催化劑是有機催化劑。在一些實施方案中，第二催化劑是胺催化劑。在一些實施方案中，第二催化劑是4-二甲基氨基吡啶(dmap)。在一些實施方案中，使式(v)的化合物脫保護包括使式(v)的化合物與約50?mol%的第二催化劑接觸。

441、在一些實施方案中，在式(vi)的化合物上安裝亞磷酰胺基團包括使式(vi)的化合物與第四堿接觸。在一些實施方案中，第四堿是有機堿。在一些實施方案中，第四堿是胺堿。在一些實施方案中，第四堿是三乙胺(tea)或n,n-二異丙基乙胺(dipea)。在一些實施方案中，第四堿是n,n-二異丙基乙胺(dipea)。在一些實施方案中，在式(vi)的化合物上安裝亞磷酰胺基團包括使式(vi)的化合物與亞磷酰胺試劑接觸。

442、在一些實施方案中，亞磷酰胺試劑是，其中x5是離去基團。在一些實施方案中，x5是鹵代基。在一些實施方案中，x5是–cl、–br或–i。在一些實施方案中，x5是–cl。在一些實施方案中，亞磷酰胺試劑是2-氰基乙基n,n-二異丙基氯亞磷酰胺。在一些實施方案中，在式(vi)的化合物上安裝亞磷酰胺基團包括使式(vi)的化合物與第五溶劑接觸。在一些實施方案中，第五溶劑是鹵化溶劑。在一些實施方案中，第五溶劑是二氯甲烷(dcm)或二氯乙烷(dce)。在一些實施方案中，第五溶劑是二氯甲烷(dcm)。在一些實施方案中，在式(vi)的化合物上安裝亞磷酰胺基團包括將反應溫度降低至約10℃以下。在一些實施方案中，在式(vi)的化合物上安裝亞磷酰胺基團包括將反應溫度降低至約-10℃至約10℃。在一些實施方案中，在式(vi)的化合物上安裝亞磷酰胺基團包括將反應溫度降低至約0℃。

443、本文公開了一種式(a)的化合物：

444、(a)

445、其中

446、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

447、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

448、本文另外公開了一種式(i)的化合物：

449、(i)

450、其中

451、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

452、本文另外公開了一種式(ii)的化合物：

453、(ii)

454、其中

455、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

456、本文另外公開了一種式(iii)的化合物：

457、(iii)。

458、本文另外公開了一種式(iv)的化合物：

459、(iv)

460、其中

461、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

462、本文另外公開了一種式(v)的化合物：

463、(v)

464、其中

465、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

466、本文另外公開了一種式(vi)的化合物：

467、(vi)

468、其中

469、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

470、本文公開了一種組合物，其包含式(a)的化合物：

471、(i)

472、其中

473、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

474、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

475、本文另外公開了一種組合物，其包含式(i)的化合物：

476、(i)

477、其中

478、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

479、本文另外公開了一種組合物，其包含式(ii)的化合物：

480、(ii)

481、其中

482、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基。

483、本文另外公開了一種組合物，其包含式(iii)的化合物：

484、(iii)。

485、本文另外公開了一種組合物，其包含式(iv)的化合物：

486、(iv)

487、其中

488、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

489、本文另外公開了一種組合物，其包含式(v)的化合物：

490、(v)

491、其中

492、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

493、本文另外公開了一種組合物，其包含式(vi)的化合物：

494、(vi)

495、其中

496、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3。

497、在一些實施方案中，r1是–me。在一些實施方案中，r1是–et。在一些實施方案中，r1是–ch2och3。在一些實施方案中，r1是–(ch2)2och3。

498、在一些實施方案中，r2是h或c1-c3烷基。在一些實施方案中，r2是h、–me、–et或–npr。在一些實施方案中，r2是–me。

499、在一些實施方案中，r3是h或c1-c3烷基。在一些實施方案中，r3是h、–me、–et或–npr。在一些實施方案中，r3是–me。

500、在一些實施方案中，式(a)的化合物是式(a1)的化合物：

501、(a1)。

502、在一些實施方案中，式(i)的化合物是式(i-a)的化合物：

503、(i-a)。

504、在一些實施方案中，式(a)的化合物是式(ii-a)的化合物：

505、(ii-a)。

506、在一些實施方案中，式(a)的化合物是式(iii-a)的化合物：

507、(iii-a)。

508、在一些實施方案中，式(a)的化合物是式(iv-a)的化合物：

509、(iv-a)。

510、在一些實施方案中，式(a)的化合物是式(v-a)的化合物：

511、(v-a)。

512、在一些實施方案中，式(a)的化合物是式(vi-a)的化合物：

513、(vi-a)。

514、本文公開了一種用于使用式(a)的化合物：

515、(a)

516、制備包含式(b)的一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法：

517、(b)，

518、其中

519、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

520、每個符號代表與核苷間鍵的連接點。

521、本文另外公開了一種用于使用式(i)的化合物：

522、(i)

523、制備包含式(b)的一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法：

524、(b)，

525、其中

526、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基；并且

527、每個符號代表與核苷間鍵的連接點。

528、本文另外公開了一種用于使用式(ii)的化合物：

529、(ii)

530、制備包含式(b)的一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法：

531、(b)，

532、其中

533、r2和r3各自獨立地是h或c1-c6烷基；并且

534、每個符號代表與核苷間鍵的連接點。

535、本文另外公開了一種用于使用式(iii)的化合物：

536、(iii)

537、制備包含式(b)的一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法：

538、(b)，

539、其中

540、每個符號代表與核苷間鍵的連接點。

541、本文另外公開了一種用于使用式(iv)的化合物：

542、(iv)

543、制備包含式(b)的一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法：

544、(b)，

545、其中

546、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

547、每個符號代表與核苷間鍵的連接點。

548、本文另外公開了一種用于使用式(v)的化合物：

549、(v)

550、制備包含式(b)的一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法：

551、(b)，

552、其中

553、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

554、每個符號代表與核苷間鍵的連接點。

555、本文另外公開了一種用于使用式(vi)的化合物：

556、(vi)

557、制備包含式(b)的一個或多個間隔基的剪接轉換寡核苷酸的方法：

558、(b)，

559、其中

560、r1是–me、–et、–ch2och3或–(ch2)2och3；并且

561、每個符號代表與核苷間鍵的連接點。